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崇明东滩国际重要湿地面积为326平方公里，属长江口典型的河口湿地。其中，自然保护区的面积为241.55平方公里，包括1998～2001年大堤以外的潮间带滩涂和水域；堤内以鱼蟹塘和水稻田为主的人工湿地面积约为为85平方公里，也是迁徙水鸟的重要栖息地。
每年的秋冬是观鸟的最佳季节，那时候大量的雁鸭类在这里过冬，它们在保护区的补充栖息地——人工鱼塘内休息，种群数量有上千只，大家可以想象到，上千只野鸭子在天空中盘旋，黑压压一片，非常壮观。另外珍稀的白头鹤也会出现在保护区内，当遇大潮时白头鹤会停留在大堤500米开外，这是观赏白头鹤的最好时机。
当然，东滩湿地除了鸟类，还拥有其它丰富的生物资源，在现有的10种兽类、73种鱼类和31种甲壳类当中，许多重要种类，如：国家一级保护野生动物白暨豚和中华鲟、经济特产种类大闸蟹和素有“软黄金”之称的鳗苗等，还有如泥螺，日本沼虾，海瓜子，等种类繁多，资源丰富的经济动物，它们的重要生活史，如觅食、繁殖、幼体育肥等都依赖这一特殊水域。崇明东滩现已查明的物种还包括两栖爬行动物16种、软体动物21种、环节动物13种、昆虫73种。
